本校為國立大學，主要收入來源為學校教學研究補助收入與學雜費收入，所有經費收支與運用，依循國立大學校院校務基金設置條例、預算法、會計法、內部審核處理準則等相關規範辦理。
本校近三年度餘絀波動原因除2018 年度辦理三峽校區營建土石方標售收入約2,000萬元屬一次性收益外，2019 年度支出增加主要以用人費用（含計時與計件人員酬金）及配合耐用年限估計變動調整增加各項不動產設備折舊為主，另補助計畫收入之減少亦對本校各項支出產生實質衝擊。
實際校務基金運作情形，請至本校基金預算執行狀況查詢系統參閱。
財務風險評估
依國立大學校院校務基金管理及監督辦法第30 條，出現學校年度決算實質短絀、人事費用支出超過最近年度決算收入百分之五十、可用資金過低等指標時，教育部得命學校限期改善。
根據上述財務風險預警指標事項，本校近年財務狀況均為實質賸餘，人事費用支出亦未超過最近年度決算收入百分之五十，且可用資金亦無過低等指標致教育部要求限期改善之情形，賡續仍秉持永續發展精神，積極辦理開源節流措施，以符校務發展需求。